Všechny vzorky jsou zpracovány v souladu se Správnou laboratorní praxí (SLP), ČSN 15189 a Správnou výrobní praxí v oblasti krevní banky (SVP KB). Laboratoře se pravidelně účastní celostátního externího hodnocení kvality (EHK), kontrolních inspekcí SÚKL a jsou držitelem Osvědčení o splnění podmínek Auditu II Národního autorizačního střediska pro odbornosti 801, 818, 222.
Součástí oddělení klinických laboratoří je odběrová místnost, která se nachází v budově transfuzního oddělení.